Xavier Descombes
Chef D'quipe

Morphomtrie computationelle et analyse morphologique dynamique des structures cellulaires et supra-cellulaires

Lquipe Morpheme est le produit dun projet collaboratif entre trois instituts locaux : le centre INRIA Mditerrane (Sophia Antipolis), le laboratoire I3S (Informatique, Signaux et Systmes ; Sophia Antipolis) et liBV (Institut de Biologie Valrose ; Nice). Cette quipe multi-disciplinaire est compose de chercheurs en mathmatiques, sciences du numriques, optique, biologie cellulaire et biologie du dveloppement. En combinant imagerie in vivo, traitement dimages et modlisation numrique, elle cherche comprendre les changements morphologiques ayant lieu lors du dveloppement des organismes multicellulaires. Afin de caractriser le dveloppement de structures subcellulaires dans des contextes sauvages et pathologiques, lquipe dveloppe des mthodes permettant dimager diffrents chantillons avec une forte rsolution, ainsi que dextraire des paramtres quantitatifs des images obtenues. Elle labore galement des outils danalyse statistique et de classification de structures complexes qui prennent en compte la variabilit inhrente aux chantillons biologiques. Enfin, des modles permettant dexpliquer lvolution temporelle des structures observes sont labors.

Les questions biologiques tudies par lquipe incluent la mise en place des arborisations axonales dans les cerveaux en cours de maturation, lanalyse des rseaux vasculaires dans des cerveaux sains et malades ainsi que la croissance des mristmes floraux. Lquipe est ouverte de nouvelles collaborations cadrant avec ses intrts scientifiques et son expertise.

Plus d'information du l'quipe Morpheme ...

Extraction d'arborescences axonales partir dimages confocales

Image brute

Reconstruction automatique

Reconstruction manuelle

 

 

 


Segmentation des rseaux vasculaires crbraux obtenus par microtomographie

 

 
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iBV - Institut de Biologie Valrose
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Parc Valrose
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